Kegiatan Pembelajaran di Universitas Muhammadiyah Sidoarjo dilaksanakan dengan mengintegrasikan nilai-nilai Islam sesuai dengan Visi dan Misi UMSIDA untuk menciptakan pengajaran secara profesional dalam pengembangan IPTEKS berdasarkan nilai-nilai Islam.
Integrasi nilai-nilai Islam dalam pembelajaran dilakukan melalui pembiasaan membaca do’a dan Al-Qur’an (5 – 10 ayat) di bimbing dosen pada Perkuliahan jam pertama serta memasukkan nilai-nilai Islam dan Kemuhammadiyahan dalam Rencana Pembelajaran Semester dan materi pembelajaran.
